Бикластеризация
В этом разделе мы опишем проблематику задачи и дадим основные определения, которыми оперирует бикластеризация как метод анализа данных. Помимо это будут приведены основания для классификации методов и алгоритмов бикластеризации. В качестве таких оснований выступают следующие критерии: типы бикластеров, структура бикластеров, получаемых в ходе анализа, а также стратегии поиска, которые используют рассматриваемые алгоритмы. Отметим, что основания для классификации алгоритмов были даны раннее португальским ученым Сарой Мадейра (см. обзор по методам бикластеризации генетических данных []).
Мы используем выявленные критерии для построения таксономии методов и дополняем существующую классификацию. В частности, мы рассматриваем методы бикластеризации, которые возникли вне области биоинформатики и предназначены для решения других задач, а также теми методами, которые появились позже написания обзора [] или не вошли в него. По этой же причине мы не рассматриваем подробно те модели, которые описаны в обзорах [], [] и []. В качестве еще одного критерия классификации можно использовать область применения метода, но для этого необходимо строго типизировать задачи.
